门派系统是玩家角色成长的核心要素之一。游戏内共有多个门派供玩家选择，每个门派拥有独特的武器、技能和战斗风格。丐帮以长棍为武器，定位为高防御的MT型职业，擅长近战单体输出，生存能力较强，适合喜欢稳扎稳打的玩家。武当派使用长剑，以内功剑气为主要攻击手段，兼具单体与群体伤害能力，但防御较弱，适合追求高爆发和灵活操作的玩家。逍遥派则以风雅著称，技能以群伤为主，攻击范围广，适合喜欢高效清怪的玩家。
明教是西域神秘教派，使用斩马刀，定位为高爆发MT，破防能力突出，适合在PVP中担任主力输出。五毒派以木杖为武器，技能附带毒伤效果，综合输出能力较强，兼具持续伤害和控制能力，适合喜欢战术性战斗的玩家。天龙派位于南疆，门派成员背景复杂，使用长枪，属性均衡，适合独行侠玩家。每个门派的技能树和战斗风格差异明显，玩家需根据自身偏好选择，例如偏好近战高防可选丐帮或明教，偏好远程群伤则可选逍遥或武当。
门派的选择不仅影响战斗方式，还与后续的装备、内功和技能搭配密切相关。五毒派的毒伤效果需要特定装备支持才能最大化收益，而逍遥派的群伤技能则依赖范围增益属性的装备。玩家在入门派后，可通过完成门派任务提升职位等级，获取专属奖励，如武学秘籍和称号。门派职位分为文职和武职，文职侧重声望积累，武职则强调实战功绩，玩家可根据自身发展需求选择侧重方向。
后期玩法中，门派的选择还会影响PVP和团队副本的定位。明教和丐帮在团队中常担任前排抗伤角色，而武当和逍遥则更多负责远程输出。部分门派拥有独特的控制技能，如五毒的毒伤减速和天龙的眩晕效果，在PVP中能发挥关键作用。玩家若想更换门派，需通过特定NPC接引，但需注意门派更换可能导致部分专属资源无法继承，因此初期选择需谨慎。
卧虎藏龙的门派系统设计注重多样性与平衡性，不同门派各有优劣，没有绝对强弱之分。玩家应结合自身操作习惯和团队需求进行选择，并通过技能升级、装备强化和职位晋升逐步提升门派专属优势，从而在江湖中立足。
